我正在尝试对通过Nextflow v.25.04.7提交的SLURM作业进行自定义，以用于追踪用途。然而，在多次尝试和测试之后，我仍然无法弄清楚正确的语法。以下是我尝试的几个测试：

 withLabel: large_res {
    executor = "slurm"
    executor.jobName = "${params.projectName}_${task.name}_${task.hash}"
    cpus = 8
    memory = 100.GB
    time = 24.h
    clusterOptions = "--account=myGroup --qos=myGroup-b"
  }

这会产生以下警告和错误：

WARN: Cannot read project manifest -- Cause: No such property: jobName for class: java.lang.String
ERROR ~ No such variable: jobName

我也尝试在集群选项中修改作业名：

withLabel: large_res {
    executor = "slurm"
    // executor.jobName = "${params.projectName}_${task.name}_${task.hash}"
    cpus = 8
    memory = 100.GB
    time = 24.h
    clusterOptions = "--account=myGroup --qos=myGroup-b --job-name=${params.projectName}_${task.name}_${task.hash}"
  }

这会导致如下错误：

ERROR ~ Unknown config attribute
process.withLabel:large_res.task.name -- check config file:
/nextflow.config

我不确定下一步该怎么做。你能帮忙吗？

编辑：当然，“#SBATCH directives are read directly by Slurm, so shell-specific syntax including variable names will be read as literal text.”。因此，clusterOptions不是办法，我需要学习如何更改执行器变量；然而，在线查阅了好几个小时，仍未找到办法。

解决方案

我是在profile中配置了作业名称，而不是在标签中。也许这对你有帮助：

profiles {
    cluster {
        process {
            executor = 'slurm'
        }
        executor {
            jobName = { task.tag ? "PipelineName-${task.name}" : "PipelineName-${task.process}" }
        }
    }
}

也许你需要把你的名称声明为闭包，这样它们在运行时才会被求值？